Die Forscher entwickelten ein Computer-Modell für den menschlichen MEK1, ein protein mit potential als drug target für eine Vielzahl von menschlichen Krebserkrankungen.
Die Initiierung und progression von Krebszellen auftreten, wenn molekularen Signale involviert in die zelluläre proliferation schief gehen. MEK1 spielt eine wesentliche Rolle bei der Signalübertragung im gesunden und Krebszellen. Ist zwar viel bekannt ist über die bedeutende Rolle von MEK1 in solchen Signalisierung von Ereignissen, die Wissenschaftler wissen immer noch nicht, die strukturellen Merkmale des MEK1, führen zu seiner Aktivierung in diesen Veranstaltungen.
Wie berichtet in der Zeitschrift Journal of Chemical Information and Modeling, eine Gruppe von Forschern an der Cal Poly San Luis Obispo, geführt von Ashley McDonald und Mitarbeiter Javin Oza entwickelt haben, rechnerische Modelle für die Struktur der menschlichen MEK1-Enzym.
„Da wir nicht wissen, die Struktur des MEK1, haben wir festgestellt, andere Proteine ähnliche Funktionen und Mechanismen der Aktion,“ sagte McDonald. „Mit diesen Strukturen, die als Vorlagen, konnten wir konstruieren Modelle von MEK1, und bestätigen Sie anschließend, diese Modelle anhand der wichtigsten Merkmale identifiziert, die durch unsere Biochemiker Mitarbeiter.“
Biochemische Charakterisierung von Proteinen, wie MEK1 bleibt besonders anspruchsvoll, weil Sie Unterziehen änderungen genannt Phosphorylierung, die können erheblich verändern die Proteinstruktur und-Funktion. Im Fall von MEK1, Phosphorylierung aktiviert das Enzym und überträgt das signal für die zelluläre proliferation.
„Unsere Lücke im Verständnis der Biochemie der phosphorylierten Enzyme wie MEK1 ist zum Teil aufgrund der technischen Herausforderungen bei der Beschaffung von nützlichen Mengen von reinem, aktiven Enzym,“ sagte Oza. „Computational modeling hat uns erlaubt, diese Lücke zu schließen und hat Einblicke in das, was MEK1 Aussehen könnte im inneren der Krebszelle.“
Diese Einblicke in die Struktur des MEK1 öffnen Sie die Tür, um die Entwicklung von neuen Klassen von Inhibitoren, die könnte potential haben, als Krebs-Therapeutika.
„Diese Forschung zeigt, dass es große Versprechen für die Kombination von rechnerischen und experimentellen Wissenschaft zu bieten einzigartige Einblicke in die Probleme, die sind schwer zu studieren,“ sagte McDonald.
Mit den Modellen der aktiven MEK1 jetzt zur Verfügung stehen, können die Wissenschaftler verfolgen mit experimentellen Methoden zu entdecken, wie das protein die Struktur regelt Funktion. Die Kombination von Computer-Modellierung und biochemische Charakterisierung von MEK1 und Enzymen, wie es hat das Potenzial, neue Einblicke in die Entwicklung von Medikamenten für die tumor-spezifische Therapeutika.