Forscher von der Walter und Eliza Hall-Institut haben dazu beigetragen, dass der jahrzehntelange weltweite Anstrengungen, die offenbart hat, zwei neue gen-Mutationen, die zu einer seltenen Art von Epilepsie.
Das Institut research-team verfolgt eine genetische mutation zurück zu seinem Ursprung; ein Individuum mit der spontanen mutation, die lebten vor mehr als 5000 Jahren. Das team entwickelt Technologien, die erkennen können, die spezifische Mutationen—die so genannte repeat-Expansionen—auch in kleinen sample-Gruppen, und die Werkzeuge, um zu verfolgen die Herkunft der mutation auf seine Herkunft.
Die Entdeckungen wurden veröffentlicht in back-to-back-Papieren in Nature Communications. Dr. Mark Bennett, Dr. Haloom Rafehi und Professor Melanie Bahlo aus dem Institut waren Teil des internationalen Konsortiums, welches im Lieferumfang enthalten Klinikern, bioinformatikern und Biologen aus Australien, Deutschland, Frankreich und den Niederlanden.
Wiederholen Sie die Probleme
Familiäre Erwachsenen myoklonischen Epilepsie (FAME) ist eine seltene form der Epilepsie, läuft in Familien und beginnt in der Regel in einer person 20s oder 30s. Es ist verursacht durch eine „dominante“ genetische mutation, was bedeutet, dass, obwohl es ist selten in der Allgemeinen Bevölkerung, Kinder von betroffenen Eltern haben eine 50/50 chance zu Erben die Krankheit. Es gibt mehrere Subtypen der RUHM, genannt FAME1, FAME2, FAME3 und FAME4.
Institute Forscher, Teil eines engagierten internationalen Bemühungen, über zwei Jahrzehnten Jagd auf die genetische Ursache der Epilepsien. Jetzt haben Forscher entdeckt, die Mutationen in den Genen STARD7 und MARCH6—, die Ursache FAME2 und FAME3, beziehungsweise.
Die genetischen Mutationen sind eine ungewöhnliche Art die so genannte repeat-Expansionen. Wiederholen Sie die Erweiterungen sind in der Regel in Zusammenhang mit neurologischen Erkrankungen, darunter Chorea Huntington, Ataxie, Autismus und RUHM.
Dr. Rafehi sagte, die Entdeckung der genetischen Ursache dieser Erkrankung helfen könnte, um zu diagnostizieren, den Patienten mit RUHM und anderen neurologischen Erkrankungen, verursacht durch repeat-Expansionen.
„Wir wissen, dass eine genetische Diagnose ist sehr wichtig für den Patienten, Antworten zu geben, und ermöglicht es Ihnen, um die Fortschritte bei der Familienplanung Optionen und mögliche Behandlungen“, sagt Dr. Rafehi sagte.
„Und jetzt, zum ersten mal, die Familien mit Verdacht auf RUHM bezeichnet werden kann für die Prüfung, mit einer hohen Möglichkeit, ein Leben verändern, definitive genetische Diagnostik.“
Ein Jahrzehnte langes Geheimnis
Das Bahlo Labor entwickelt hoch spezialisierte Bioinformatik-tools zu identifizieren, wiederholen Sie die Erweiterungen, indem Sie an der Spitze der Suche nach diesen seltenen Erkrankungen.
Dr. Bennett sagte, die Forscher weltweit hatte, verbrachte mehr als zwei Jahrzehnten mit der Suche nach genetischen Mutationen, verursacht FAME in Familien aus Australien und der ganzen Welt.
„Im vergangenen Jahr gab es einen Durchbruch in der Ermittlung der genetischen Ursache für familiäre Erwachsenen myoklonischen Epilepsie, mit der Entdeckung, dass diese Krankheit wird verursacht durch eine repeat-expansion“, so Dr. Bennett sagte.
„Die Erkennung wiederholen Sie die Erweiterungen in der DNA kann sehr schwierig sein. Unser Labor hat ein tool entwickelt, genannt exSTRa (erweitert short-tandem-repeat-Algorithmus), die Suche kann das gesamte Genom für die repeat-Expansionen, auch mit kleinen Datensätzen. Dies ist wichtig, da typische Analyse-Methoden nicht erkennen können, wiederholen Sie die Erweiterungen, so dass Sie oft nicht als Ursache von Krankheit.“
Er sagte, die Institute research-team verwendet exSTRa unabhängig zu überprüfen, die Gene, wurden mutiert, die in diesen Familien mit RUHM.
„Viele dieser Patienten haben, warten seit Jahren, sogar Generationen—zu wissen, die Ursache Ihrer Krankheit. Dank dieser Entdeckung, haben Sie endlich eine Antwort haben,“ Dr. Bennett sagte.
„Die Identifizierung der Gene linked to FAME ist ein wichtiger Schritt im Verständnis dieser Krankheit, die wir hoffen, wird schließlich führen zu besseren Diagnose-und Behandlungsmöglichkeiten für Patienten.“
Eine uralte Frage
Dr. Rafehi eine software entwickelt, die es ermöglichte, dass die Forscher auf die Spur, die genetischen Stammbaum eines der Mutationen, MARCH6.
„Durch den Vergleich der DNA-Sequenz, die sich um die mutation, konnten wir zeigen, dass alle Patienten mit dem Subtyp FAME3 haben die gleiche mutation von MARCH6, die uns sagt, sind Sie alle entfernten verwandten“, so Dr. Rafehi sagte. „Wir waren auch in der Lage zu schätzen das Alter der mutation, und zeigte, dass FAME3 begann als eine einzige, spontane mutation in einem einzelnen europäischen 253 Generationen—mehr als 5000 Jahre her.“
Dr. Rafehi sagte, die Schätzung des Alters der genetischen mutation war nicht nur Neugier, es auch wertvolle Informationen über die Krankheit und Ihre Muster der Ausbreitung.