Drug-discovery-software am Southwest Research Institute ist die Erweiterung der Kapazität auf nahezu screen Drogen-verbindungen für die mögliche Behandlung von Corona-Virus und anderen Infektionskrankheiten.
SwRI ist Rhodium virtuellen screening-Instrument bewertete kürzlich die 2 Millionen Drogen-verbindungen in ein paar Tagen, in der Hoffnung zu identifizieren, die mit hoher Wahrscheinlichkeit Medikamente, die die Wirksamkeit gegen den coronavirus mit minimalen Nebenwirkungen. Institut Wissenschaftler initiiert, die molekularen Modellierung Forschung mit SwRI internen Finanzierung.
„Im Einklang mit SwRI‘ s mission, die Entwicklung von medizinischen Gegenmaßnahmen für beide Natürliche und vom Menschen verursachte Bedrohungen, verwenden wir diese proprietäre molecular modeling-software zu helfen, die Forschung screen-Arzneimittel-Kandidaten für die Zukunft coronavirus Forschung,“ sagte Dr. Jonathan Bohmann, eine SwRI principal scientist führende Forschung.
Auf der Grundlage der Ergebnisse der Modellierung, SwRI team mit lokalen Forschungspartnern, wie das Texas Biomedical Research Institute, die für die nächste phase der Studien zu bestimmen, die am wirksamsten Kandidaten für die weitere Arzneimittelentwicklung und ultimate Bereitstellung virus betroffenen Regionen.
Vor der letzten Corona-Virus-Ausbruch, SwRI erhöht die Kapazität der Rhodium-software zum Scannen von 250.000 Medikament verbindungen pro Tag, bis aus seine Vorherige limit von 25.000. Forscher verbessert die Fähigkeit, mit neuen grafischen Datenverarbeitung, software-updates und machine-learning-Techniken. Ein 3-D-Modell eines coronavirus wurde verwendet, um zu bewerten, potentielle Medikamente, die Sie aus einer umfangreichen Bibliothek von verbindungen.
„Diese erweiterte Verarbeitung Fähigkeiten demonstriert, dass virtual screening können schnell erhöhen Sie das Tempo der arzneimittelentdeckung, vor allem in Pandemie-Situationen,“, sagte Dr. Shawn Blumberg, ein SwRI Forscher Unterstützung bei der Anstrengung.
Virtual screening gilt rechnergestützte Techniken zur Bewertung von kleinen Molekülen und vorherzusagen, wie protein-Strukturen in Infektionskrankheiten binden mit Drogen-verbindungen. Drogen-Macher dreht sich um die computational screening als eine sichere, effiziente und Kosten-effektive alternative zur Evaluierung der physischen Proben in einem Labor in den frühen Phasen der Medikamenten-Entwicklung.
„Rhodium, zum Beispiel, kann verwendet werden, um zu finden, die sehr wahrscheinlich verbindungen von Datenbanken mit Hunderten von tausenden von Wirkstoff-Kandidaten vor der Bank die Prüfung in einem Labor,“ Bohmann Hinzugefügt.
Rhodium verwendet drug compound-Bibliotheken, um vorherzusagen, wie protein-Strukturen in Infektionskrankheiten binden mit verbindungen oder eine Reihe von verbindungen bekannt, die als Liganden. Rhodium ist der hohe Durchsatz 3-D-Analyse von protein-docking, effizient wählt Liganden vorherzusagen, wie eine Verbindung interagiert mit dem protein-Struktur. Die machine learning-tools interpretieren Rangfolge nach Analyse der Ergebnisse für eine schnellere Analyse der Daten.