Finden Leukämie Schwäche mit Genom-weiten CRISPR-Technologie

Ein team von Forschern an der University of California San Diego School of Medicine und Moores Cancer Center verwendet CRISPR-Technologie zum identifizieren von Schlüssel-Regulatoren des aggressiven chronischen myeloischen Leukämie, eine Art von Krebs, bleibt schwierig zu behandeln und ist gekennzeichnet durch häufige Rückfall.

„Wir CRISPR-Technologie für die Durchführung eines genomweiten screen in Leukämie-Zellen zu blockieren Tausende von Genen auf einmal. Dies ist ein extrem leistungsfähiges Werkzeug, das uns erlaubt, zu identifizieren, die eine Vielzahl von Genen, die die Kraftstoff-Leukämie-Wachstum und neue Schwachstellen anvisiert werden können, die in dieser Krankheit,“, sagte senior-Autor Tannishtha Reya, Ph. D., professor in den Abteilungen von Pharmakologie und von Medizin. „Die Studie zeigt auch, zum ersten mal, dass die ganzen Genoms CRISPR-Bildschirme können in der Tat durchgeführt werden, in einer Weise, die viel mehr physiologisch relevant ist: die mit primären Krebs-Zellen, und in der Einstellung der einheimischen Mikrokosmos.“

Die Berichterstattung in der April-20, 2020 online-Ausgabe der Zeitschrift Nature Cancer, Reya und Kollegen identifizierten RNA-bindenden Proteine, die normalerweise Steuern, wie, Wann und ob die Zellen bestimmte Proteine—als eine wichtige Klasse von Proteinen, die unterstützen und schützen Medikamenten-resistenten Leukämie-Stammzellen. Die Autoren konzentrierten sich auf das staufen2 (Stau2), eine relativ unerforschte Mitglied des RNA-bindenden protein-Familie, war bisher nur bekannt, zu Steuern, Gehirn und Nervensystem-Entwicklung.

Diese Arbeit wurde in Zusammenarbeit mit der UC San Diego-Ermittler-Gen Yeo, Ph. D., und Anjana Rao, Ph. D., und wurde durchgeführt von lead-Autor Jeevisha Bajaj, Ph. D., während Sie war ein postdoctoral fellow an der UC San Diego in der Reya-Labor. Bajaj danach trat der University of Rochester Medical Center, assistant professor für biomedizinische Genetik und Forscherin an der Wilmot-Krebs-Institut.

Das team entwickelte ein Mausmodell, in dem Stau2 war genetisch gelöscht und festgestellt, dass der Verlust dieses proteins führte zu einer tiefgreifenden Reduzierung Leukämie Wachstum und Vermehrung, und deutlich verbesserten Gesamtüberleben in Maus-Modellen. Stau2 war es auch erforderlich, für das weitere Wachstum der primären Gewebe-Proben von Patienten mit Leukämie, was auf eine konservierte Abhängigkeit in der menschlichen Krankheit.

„Wir freuen uns besonders über diese Arbeit, denn nach unserem wissen ist dies die erste demonstration, dass das staufen2-ist eine wesentliche Abhängigkeit in Krebs,“ sagte Reya, wer ist Mitglied von Moores Cancer Center und Sanford Consortium for Regenerative Medicine.

Um zu verstehen, wie Stau2 steuert, Krebs, Forscher, unternahm eine genome-scale computational Analyse Ihrer Ziele durch RNA-Seq und eCLIP-Seq. Dies führte zu der Entdeckung, dass dieses protein steuert Schlüssel-Onkogene, wie Ras, und epigenetischen Regulatoren, wie den LSD/KDM Familie von Proteinen, die entscheidend targets getestet gegen Leukämie und andere Krebsarten.

Nach Angaben des National Cancer Institute, etwa 1,5 Prozent der Männer und Frauen werden mit der Diagnose Leukämie irgendwann in Ihrem Leben. Während die chronisch myeloische Leukämie (CML) kann gesteuert werden mit gezielten Therapien kann diese Krankheit tödlich sein, wenn es Fortschritte oder ist diagnostiziert eine akute „blast“ – phase. Die Befunde haben auch Implikationen für die akute myeloische Leukämie (AML) und anderen Blutkrebs.